More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0145 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  71.01 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  69.78 
 
 		 154 aa  203  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  71.64 
 
 		 161 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  73.08 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  66.92 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  66.15 
 
 		 142 aa  186  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  62.88 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.91 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  62.88 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  65.15 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.19 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.88 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  61.54 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  58.7 
 
 		 139 aa  170  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.03 
 
 		 159 aa  169  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  62.79 
 
 		 173 aa  169  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  58.78 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  60.71 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  57.66 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  59.12 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  62.31 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  62.02 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  58.52 
 
 		 195 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  58.52 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  58.52 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  57.66 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  59.85 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  56.93 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  60.16 
 
 		 174 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  56.72 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  56.49 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  57.81 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  56.34 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  56.49 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.14 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  52.99 
 
 		 173 aa  146  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  68.57 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.22 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  68.69 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  68.69 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.51 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  45.32 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  47.45 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  32.12 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  32.12 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  27.41 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.25 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  29.85 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.19 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  26.56 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  36.51 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  26.56 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  30.71 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  26.56 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  28.15 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>