More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4608 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
333 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.44 
 
 
327 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.44 
 
 
327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  79.08 
 
 
336 aa  504  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.75 
 
 
356 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.57 
 
 
338 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  61.83 
 
 
340 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  61.68 
 
 
327 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.19 
 
 
352 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 
350 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.46 
 
 
328 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 
328 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.56 
 
 
328 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 
327 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  62.07 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.01 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  61.08 
 
 
403 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.92 
 
 
324 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 
333 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.54 
 
 
336 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 
324 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 
331 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 
332 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 
334 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 
326 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 
332 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 
325 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 
352 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  58.31 
 
 
354 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.18 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.44 
 
 
325 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.79 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  57.14 
 
 
328 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.88 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 
333 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 
334 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.01 
 
 
347 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.32 
 
 
333 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.16 
 
 
336 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.93 
 
 
333 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.89 
 
 
326 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.23 
 
 
338 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.83 
 
 
335 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
340 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
340 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 
334 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
352 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  59.26 
 
 
338 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
350 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
350 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
340 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.07 
 
 
350 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
330 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  57.01 
 
 
336 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.18 
 
 
336 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.18 
 
 
336 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 
334 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  57.59 
 
 
330 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.56 
 
 
325 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 
326 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
324 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 
340 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.36 
 
 
324 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.49 
 
 
340 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.51 
 
 
378 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 
322 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
326 aa  374  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  60.53 
 
 
324 aa  374  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.79 
 
 
342 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
351 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.79 
 
 
330 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 
352 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
351 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.23 
 
 
333 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.89 
 
 
352 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.79 
 
 
326 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.71 
 
 
333 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.06 
 
 
335 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.11 
 
 
330 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 
329 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 
325 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.46 
 
 
329 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
343 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 
335 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.15 
 
 
363 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.41 
 
 
358 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 
351 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 
335 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 
338 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 
331 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
339 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.44 
 
 
329 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 
362 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 
360 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 
328 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.35 
 
 
335 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 
337 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>