More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0581 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  79.4 
 
 		 413 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  82.93 
 
 		 413 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  84.44 
 
 		 415 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  85.85 
 
 		 413 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  77.57 
 
 		 420 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  83.41 
 
 		 413 aa  718    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  81.27 
 
 		 411 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 409 aa  850    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  82.44 
 
 		 413 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  73.57 
 
 		 417 aa  628  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  74.18 
 
 		 417 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  73.92 
 
 		 417 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  72.29 
 
 		 414 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  74.06 
 
 		 421 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  71.79 
 
 		 414 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  72.52 
 
 		 418 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  73.02 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  72.47 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  71.14 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  71.79 
 
 		 414 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.25 
 
 		 409 aa  542  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 		 410 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 402 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.02 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 402 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  64.07 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  64.11 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  65.99 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  64.07 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 391 aa  527  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  64.2 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  62.62 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  63.96 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  64.62 
 
 		 399 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  65.24 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.39 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  64.65 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  63.46 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  64.65 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  63.96 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.74 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 404 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  61.12 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.29 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 404 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.8 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  64.62 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  62.97 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  60.64 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  60.64 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  63.85 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  61.87 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  62.13 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  61.69 
 
 		 411 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  61.63 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  63.34 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>