More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4735 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  41.53 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  46.6 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  36.97 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  42.59 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  40.17 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  46.05 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  35.09 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  55.77 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  39.45 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 343 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  33.02 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.05 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.09 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  31.73 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  41.1 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.64 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 343 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  31.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  35.71 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 343 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>