More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4385 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4385  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
322 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  77.26 
 
 
317 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  75.63 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  72.5 
 
 
322 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  68.75 
 
 
320 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0464  NADH dehydrogenase (quinone)  72.1 
 
 
320 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0393  NADH dehydrogenase (quinone)  69.69 
 
 
320 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.15 
 
 
348 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  48.63 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.48 
 
 
349 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  48.97 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  45.48 
 
 
349 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  48.63 
 
 
333 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.81 
 
 
349 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
348 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  47.73 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  43.13 
 
 
349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.36 
 
 
349 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.27 
 
 
329 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.91 
 
 
353 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  43.96 
 
 
341 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.96 
 
 
341 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 
322 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.91 
 
 
353 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.26 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.27 
 
 
329 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.43 
 
 
328 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  42.86 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.76 
 
 
331 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  41.99 
 
 
341 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  47.75 
 
 
318 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  45.24 
 
 
317 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  42.27 
 
 
390 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  41.96 
 
 
391 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  45.22 
 
 
351 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  46.08 
 
 
323 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  42.95 
 
 
447 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.31 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.61 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  41.46 
 
 
384 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  40.52 
 
 
372 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  42.81 
 
 
372 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.16 
 
 
331 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  39.56 
 
 
372 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  39.81 
 
 
372 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  39.81 
 
 
372 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  43.58 
 
 
329 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  46.89 
 
 
318 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  39.4 
 
 
357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
433 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
384 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  42.16 
 
 
338 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  41.97 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  40.97 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40.97 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  39.3 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  41.81 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  38.75 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.22 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  39.5 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  39.88 
 
 
413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  39.18 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  38.49 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  39.94 
 
 
372 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.5 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 
452 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.04 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.24 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  43.45 
 
 
325 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  39.87 
 
 
372 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  41.03 
 
 
321 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  40.26 
 
 
451 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  39.31 
 
 
372 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>