147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2062 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  61.64 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  39.27 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  37.68 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  37.32 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  38.29 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  38.29 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  33.99 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  33.99 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  38.49 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  34.06 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  25.38 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  31.78 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  33.07 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  39.52 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  33.15 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  30.69 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  35.18 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  35.84 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  37.63 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  32.53 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  25.5 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  26 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  30.19 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  34.29 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  29.89 
 
 		 279 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  23.29 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  34.51 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  25.64 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  25.64 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  30.04 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  28.85 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.04 
 
 		 289 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  34.6 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  31.87 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  33.33 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  28.28 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  28.73 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  29.96 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  27.8 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  30.11 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  29.71 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  34.98 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  30.88 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  33.5 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  30.04 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  34.81 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  34.81 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  30.04 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  31.28 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  30.95 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  34.84 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  28.9 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  27 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  36.64 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  32.8 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  29.66 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  31.7 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  36.64 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  27.51 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  29.1 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  29.1 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  30.4 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  32.72 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  33.15 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  29.43 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  23.48 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  24.09 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  23.36 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  29.26 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  29.61 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  27.44 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  29.29 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  31.22 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  30.85 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  29.84 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  35.57 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  32.14 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  30.85 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  36.5 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  27.37 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  31.28 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  27.71 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  28.95 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  33.97 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  31.28 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  24.23 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  26.06 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  32.31 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  29.56 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  26.74 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>