75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1250 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  727    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  28.17 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  28.07 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  24.84 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  28.2 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  27.2 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  26.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  26.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  29.84 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  30.66 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  28.63 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  28.29 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  28.29 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  30.94 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  30.68 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  30.68 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  30.68 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  30.68 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  30.68 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  30.68 
 
 		 407 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  30.68 
 
 		 541 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  24.78 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  26.28 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  23.25 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  22.69 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  22.39 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  24.05 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  28.73 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  25.17 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  25.68 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  25.45 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  29.22 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  29.94 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  29.45 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  29.76 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  27.23 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  28.22 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  27.92 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  24.52 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.56 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  26.97 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  30 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  22.55 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  27.27 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  26.26 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  28.16 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1416  hypothetical protein  23.08 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1568  hypothetical protein  23.72 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  21.18 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  24.14 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  22.99 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  30 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  21.12 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.96 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.96 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  23.76 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  25.37 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  25.37 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  19.09 
 
 		 401 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.86 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  30.88 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  19.94 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  23.35 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  29.09 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.28 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>