25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0635 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  30.99 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  37.25 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  39.18 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  30.37 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  29.52 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  29.47 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  30.69 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  32.26 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  25.17 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  27.1 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  28.63 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  23.88 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  35.05 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  37.65 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.72 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  25.84 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  29.88 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.99 
 
 		 339 aa  45.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  31.61 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  31.25 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>