196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1223 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1223  Sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
339 aa  672    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1499  sodium/calcium exchanger membrane region  46.85 
 
 
339 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  41.59 
 
 
341 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1450  sodium/calcium exchanger membrane region  48.1 
 
 
355 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879027  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1849  sodium/calcium exchanger membrane region  40.43 
 
 
361 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.353414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  39.94 
 
 
347 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0538  sodium/calcium exchanger membrane region  39.76 
 
 
347 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12780  Ca2+/Na+ antiporter  38.67 
 
 
345 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63097  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2147  sodium/calcium exchanger membrane region  33.13 
 
 
335 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4761  sodium/calcium exchanger membrane region  29.71 
 
 
357 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  32.13 
 
 
334 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1133  sodium/calcium exchanger membrane protein  31.83 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000089866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3080  sodium/calcium exchanger membrane protein  32.15 
 
 
334 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.036167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1175  sodium/calcium exchanger membrane region  29.25 
 
 
348 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.606796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4299  sodium/calcium exchanger membrane region  32.42 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3609  sodium/calcium exchanger membrane region  31.02 
 
 
336 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.722589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0501  Ca2+/H+ antiporter  31.25 
 
 
338 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2983  sodium/calcium exchanger membrane region  32.19 
 
 
334 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39585  normal  0.0260778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  29.75 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  28.79 
 
 
343 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0850  cation transporter, putative  28.92 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0384  sodium/calcium exchanger membrane region  29.05 
 
 
336 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6944  sodium/calcium exchanger membrane region  32.58 
 
 
315 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  27.34 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.38 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1799  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.85 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.78 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.17 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.68 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.52 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.17 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  25.75 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  26.54 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.39 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  27.02 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  25.29 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  27.42 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  26.54 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.5 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.71 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  26.55 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.94 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.76 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.79 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.25 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.38 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.7 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.7 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.26 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.83 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.68 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.29 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.41 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.44 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.03 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.21 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.19 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  22.59 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.88 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.69 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  25.65 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.6 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  25.74 
 
 
316 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  25.75 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.26 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.24 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.75 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  27.41 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.87 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0308  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.85 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.68 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.59 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.72 
 
 
314 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.9 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.29 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.9 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.2 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.9 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.71 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.91 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  24.82 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  22.27 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  28.19 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.16 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  27.84 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1218  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.34 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  35.23 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>