More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2367 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
389 aa  773    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  46.48 
 
 
402 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
460 aa  299  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  43.19 
 
 
412 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  47.75 
 
 
425 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  42.78 
 
 
437 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  46.13 
 
 
409 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  41.96 
 
 
435 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  44.62 
 
 
421 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
410 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 
421 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 
421 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 
416 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  45.24 
 
 
428 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
424 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  44.58 
 
 
415 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
411 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  54.39 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  54.58 
 
 
441 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 
378 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
422 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  58.33 
 
 
326 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  51.53 
 
 
266 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  49.15 
 
 
333 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.97 
 
 
238 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
606 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
237 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
613 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  32.08 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.49 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
238 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 
243 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
238 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
273 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
245 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  29.18 
 
 
253 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
273 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
261 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  26.67 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
236 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
243 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
237 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
272 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
267 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.26 
 
 
248 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 
780 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
256 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
289 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.58 
 
 
246 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
256 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.65 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  32.5 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
235 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.76 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  24.84 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  25.08 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.76 
 
 
248 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  25.87 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.95 
 
 
241 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.78 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
883 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
310 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
314 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
231 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.3 
 
 
255 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5297  putative dolichol-phosphate mannosyltransferase  25.97 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.95 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.45 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
586 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1604  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.7 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  28.85 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.99 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.06 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  25.23 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>