More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2059 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
168 aa  332  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  64.94 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  68.32 
 
 
172 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  62.42 
 
 
184 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  66.46 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
170 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 
181 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 
177 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
170 aa  190  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  56.63 
 
 
175 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
181 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 
181 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
180 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
179 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  60.13 
 
 
181 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
180 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
181 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  59.49 
 
 
181 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
181 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
178 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
181 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
181 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
179 aa  184  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
172 aa  184  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
174 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
186 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
174 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
179 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
172 aa  177  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
171 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
172 aa  176  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
214 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
171 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
172 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
172 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
170 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
177 aa  174  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
185 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
171 aa  174  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
173 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
175 aa  174  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
179 aa  173  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  61.82 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
178 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
171 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
172 aa  170  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  57.24 
 
 
157 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
177 aa  170  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 
184 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
187 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
174 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
178 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
171 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
171 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
170 aa  167  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
182 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
185 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
171 aa  167  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
170 aa  167  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
172 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
172 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 
182 aa  166  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
173 aa  166  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
181 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
185 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  47.02 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  61.39 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>