213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2013 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  100 
 
 
269 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  81.41 
 
 
272 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  74.81 
 
 
268 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  71.27 
 
 
266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  68.28 
 
 
266 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  70.52 
 
 
296 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  68.54 
 
 
270 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  63.37 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  64.66 
 
 
265 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  61.94 
 
 
271 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  63.81 
 
 
269 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  63.81 
 
 
269 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  64.49 
 
 
268 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  63.81 
 
 
269 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  63.81 
 
 
269 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  64.18 
 
 
268 aa  298  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  63.31 
 
 
291 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  63.14 
 
 
329 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  63.37 
 
 
276 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  62.55 
 
 
268 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  60.3 
 
 
272 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  66.39 
 
 
281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  66.4 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  63.57 
 
 
281 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  62.5 
 
 
272 aa  275  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  60.15 
 
 
267 aa  258  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  62.04 
 
 
286 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  57.44 
 
 
270 aa  248  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  57.26 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  58.78 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  52.79 
 
 
268 aa  238  8e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  53.82 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  54.8 
 
 
281 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  51 
 
 
264 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  50.38 
 
 
269 aa  229  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  51 
 
 
264 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  52.63 
 
 
266 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  50.2 
 
 
271 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  50.38 
 
 
266 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  50.74 
 
 
267 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  50.76 
 
 
272 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  52.46 
 
 
318 aa  225  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  53.23 
 
 
270 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  48.28 
 
 
284 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  51.5 
 
 
271 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  50.81 
 
 
250 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  52.46 
 
 
252 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  41.95 
 
 
270 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  43.77 
 
 
276 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  51.6 
 
 
272 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  50 
 
 
274 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  44.36 
 
 
270 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  50.92 
 
 
267 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  54.51 
 
 
348 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  51.13 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  51.48 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  52.94 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  55.06 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  52.03 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  52.03 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  45.67 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  44.4 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  46.84 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  43.72 
 
 
271 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  43.72 
 
 
271 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  50.41 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  49.39 
 
 
242 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  41.91 
 
 
270 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  45.21 
 
 
267 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  45.21 
 
 
267 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  44.4 
 
 
270 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  44.02 
 
 
266 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  52.71 
 
 
281 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  50.38 
 
 
367 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  51.67 
 
 
267 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  47.41 
 
 
279 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  45.93 
 
 
270 aa  204  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  54.51 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  47.76 
 
 
267 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  42.05 
 
 
269 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  44.13 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  48.96 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  46.94 
 
 
269 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  51.45 
 
 
264 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  49.19 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  51.67 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  45.75 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  51.25 
 
 
250 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04750  hemolysin A  48.97 
 
 
243 aa  194  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000612241  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  48.33 
 
 
251 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  52.5 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  44.08 
 
 
272 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  42.8 
 
 
269 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  45.64 
 
 
277 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  47.08 
 
 
282 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  51.57 
 
 
227 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  49.59 
 
 
246 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  47.77 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  41.67 
 
 
264 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  50.81 
 
 
249 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>