More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1194 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1194  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 512 aa  1000    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2416  ABC transporter related protein  77.8 
 
 		 564 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2781  ABC transporter related  48.06 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4051  ABC transporter related  45.76 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463588 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3910  ABC transporter related  44.27 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0472373  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5158  ABC transporter related  44.51 
 
 		 493 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.663516  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4644  ABC transporter related  43.23 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5737  ABC transporter related  42.89 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5319  ABC transporter related  43.4 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1535  ABC transporter related  42.69 
 
 		 518 aa  322  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1071  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.121101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1374  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 505 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.99 
 
 		 519 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  33.6 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  33.27 
 
 		 501 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  36.78 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  30.68 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  36.36 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0265  ABC transporter related  38 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  36.2 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  30.6 
 
 		 496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  37 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  31.45 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  36.98 
 
 		 495 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  32.81 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  31.58 
 
 		 501 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  34.72 
 
 		 513 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  38.6 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  32.07 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  36.19 
 
 		 526 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  36.05 
 
 		 526 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  33.27 
 
 		 494 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  32.49 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4826  putative ribose ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  37.55 
 
 		 496 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6251  ABC transporter related  35.26 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 510 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  33.2 
 
 		 510 aa  252  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 		 521 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.09 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  32.09 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2643  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.860718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  32.45 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  36.41 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  36.13 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1891  ABC transporter related  36.24 
 
 		 499 aa  250  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  31.94 
 
 		 499 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  33.87 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 500 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  38.55 
 
 		 502 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  33.86 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  32.28 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  31.49 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.28 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  32.28 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6816  ABC transporter related  35.52 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  33.59 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  36.63 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  32.28 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  32.46 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  34.66 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  34.47 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  31.94 
 
 		 500 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  32.28 
 
 		 501 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  32.28 
 
 		 501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  33.01 
 
 		 509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  37.42 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  31.56 
 
 		 503 aa  246  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  35.71 
 
 		 497 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  32.08 
 
 		 501 aa  246  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  32.81 
 
 		 520 aa  246  9e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 504 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  37.88 
 
 		 499 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  31.27 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  31.55 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  31.27 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  34.07 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  31.47 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  35.41 
 
 		 585 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  27.78 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  29.96 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  31.88 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  36.82 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  37.98 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>