More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0506 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 464 aa  956    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 466 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  70.02 
 
 		 467 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  80.22 
 
 		 465 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  71.12 
 
 		 465 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 480 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 481 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 487 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 549 aa  438  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  45.56 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>