42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1387 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  60.99 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  47.5 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  46.85 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  48.2 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  43.24 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  44.76 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  45.14 
 
 		 153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  41.84 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  43.88 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  39.86 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  40.97 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  42.14 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  40.54 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  42.47 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  34.44 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  34.67 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  30.87 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  37.68 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  30.2 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  38.06 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  31.08 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33.1 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  33.53 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  27.94 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  32.37 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  27.21 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  25.62 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  29.1 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.32 
 
 		 289 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  26.49 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>