263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0731 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0632  glycine--tRNA ligase  49.4 
 
 
661 aa  662    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.563385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0707  glycine--tRNA ligase  96.58 
 
 
672 aa  1324    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1054  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.34 
 
 
672 aa  674    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0731  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
672 aa  1361    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.59 
 
 
689 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  35.27 
 
 
695 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.14 
 
 
698 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.07 
 
 
686 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.57 
 
 
690 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.61 
 
 
705 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.16 
 
 
690 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  34.4 
 
 
688 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.46 
 
 
694 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.06 
 
 
686 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.14 
 
 
694 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
687 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.04 
 
 
687 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.53 
 
 
693 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.09 
 
 
702 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.58 
 
 
688 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
688 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.52 
 
 
690 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.36 
 
 
679 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
687 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.58 
 
 
687 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
678 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.82 
 
 
687 aa  362  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.49 
 
 
716 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.62 
 
 
691 aa  360  5e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  31.61 
 
 
696 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  32.71 
 
 
688 aa  359  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.67 
 
 
680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
687 aa  355  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.84 
 
 
696 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.85 
 
 
717 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.85 
 
 
688 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.21 
 
 
711 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.21 
 
 
711 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00370  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  31.65 
 
 
694 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  32.28 
 
 
690 aa  352  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.09 
 
 
701 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.13 
 
 
685 aa  348  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.72 
 
 
690 aa  347  6e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.09 
 
 
701 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.14 
 
 
696 aa  346  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  32.61 
 
 
693 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.95 
 
 
701 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.18 
 
 
696 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  32.03 
 
 
694 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.43 
 
 
689 aa  343  7e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
719 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
693 aa  341  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  31.01 
 
 
691 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.85 
 
 
728 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.65 
 
 
691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.67 
 
 
697 aa  335  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 
678 aa  335  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.55 
 
 
664 aa  332  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0601  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.79 
 
 
664 aa  332  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 
684 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.19 
 
 
685 aa  332  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0826  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
671 aa  331  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0218666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.62 
 
 
731 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.55 
 
 
692 aa  330  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.29 
 
 
697 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.45 
 
 
664 aa  330  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.99 
 
 
684 aa  329  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.32 
 
 
688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0991  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.88 
 
 
673 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
672 aa  328  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.05 
 
 
733 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.52 
 
 
689 aa  328  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1374  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.26 
 
 
673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.66 
 
 
693 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.06 
 
 
664 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.36 
 
 
697 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.8 
 
 
684 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  31.65 
 
 
688 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.04 
 
 
692 aa  324  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0694  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.14 
 
 
695 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.7209  hitchhiker  0.0000422359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.39 
 
 
692 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  31.65 
 
 
688 aa  323  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.51 
 
 
683 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.65 
 
 
684 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.51 
 
 
683 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.83 
 
 
722 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.03 
 
 
697 aa  320  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.25 
 
 
685 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.22 
 
 
689 aa  319  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.12 
 
 
693 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0184  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.72 
 
 
687 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.58113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.9 
 
 
693 aa  318  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.07 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  30.07 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.8 
 
 
673 aa  317  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  317  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>