More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0345 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  93.36 
 
 		 557 aa  1077    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 557 aa  1135    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1422  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 569 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.38449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  36.57 
 
 		 574 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 646 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 645 aa  293  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  36.2 
 
 		 701 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 643 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 		 627 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 633 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 		 646 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 		 639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 609 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 		 647 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 		 645 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.5 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  33.74 
 
 		 619 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 		 640 aa  279  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 		 630 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 632 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 		 671 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 		 681 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 643 aa  276  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 662 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 607 aa  272  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.76 
 
 		 628 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 678 aa  270  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 		 626 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 643 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 636 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 		 618 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  31.43 
 
 		 631 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.59 
 
 		 641 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 664 aa  264  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 		 634 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 642 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 646 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 634 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  37.53 
 
 		 709 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 628 aa  263  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.42 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.43 
 
 		 629 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 		 634 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.76 
 
 		 640 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 		 617 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 		 629 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.49 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  30.06 
 
 		 625 aa  256  7e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.32 
 
 		 646 aa  256  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 		 634 aa  256  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  28.95 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 631 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.78 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  29.67 
 
 		 637 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 626 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.78 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.87 
 
 		 633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 631 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  29.82 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 631 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 658 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  29.34 
 
 		 636 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 		 634 aa  252  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 646 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.41 
 
 		 615 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.1 
 
 		 612 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 618 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.07 
 
 		 647 aa  250  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>