More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2205 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  47.04 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  53.1 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  51.29 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  50 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  46.27 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  44.9 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  44 
 
 		 294 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  44 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 294 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  42.53 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  42.69 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  44 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  43.31 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.15 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  40.08 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  43.72 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 273 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  42.06 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 253 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  37.92 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.75 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.75 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  42 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  35.46 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.56 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.56 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  39.48 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.86 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.86 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.86 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  38.56 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  35.43 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  39.66 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.14 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  38.14 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  37.71 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.66 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.45 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.29 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  38.82 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  37.71 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  37.97 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>