More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1214 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1214  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.528512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.107177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.79 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.09 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.79 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  27.52 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.81 
 
 		 270 aa  62  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.26 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  28.82 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.96 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  28.84 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  27.54 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.21 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  28.19 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.87 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  26.53 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  23.89 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 		 279 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  26.83 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  26.83 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.21 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.54 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2089  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  27.69 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  27.52 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.57 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  24.06 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  27.05 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.09 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.09 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  26.99 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.37 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.53 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.11 
 
 		 702 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.16 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>