More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1096 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.39 
 
 		 464 aa  772    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.68 
 
 		 468 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.57 
 
 		 465 aa  772    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.9 
 
 		 464 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.45 
 
 		 465 aa  823    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  936    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.6 
 
 		 463 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 		 466 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.95 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.6 
 
 		 466 aa  618  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.44 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.87 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.37 
 
 		 478 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 		 479 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.3 
 
 		 465 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.39 
 
 		 480 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.56 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 479 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.16 
 
 		 479 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.1 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.35 
 
 		 473 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.32 
 
 		 479 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.84 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.58 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.05 
 
 		 477 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.63 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.33 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.53 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.64 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 		 487 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.25 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.71 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 487 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.04 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.68 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 482 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.5 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.33 
 
 		 481 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.73 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  54.63 
 
 		 457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.71 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.82 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.94 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.24 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.65 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.07 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.27 
 
 		 468 aa  461  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  49.14 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  50.97 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.67 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.17 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.72 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.29 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.34 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.58 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.86 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 		 464 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 464 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.23 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 		 464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.22 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 467 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 		 464 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 469 aa  347  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 		 465 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.6 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>