34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2758 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 343 aa  696    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  30.37 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  31.98 
 
 		 216 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  27.06 
 
 		 749 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  27.64 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  27.89 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.7 
 
 		 756 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  28.84 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  27.24 
 
 		 751 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  29.95 
 
 		 776 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  33.02 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  26.86 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  25.77 
 
 		 836 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  25.2 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  26.6 
 
 		 833 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  25.82 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  24.07 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  27.13 
 
 		 769 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  25.75 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  30.57 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  27.89 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  25 
 
 		 829 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  24.46 
 
 		 851 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  26.8 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  26.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  26.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  23.81 
 
 		 763 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  24.88 
 
 		 754 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  32.84 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  27.19 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  27.44 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  25.97 
 
 		 230 aa  46.2  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  24.26 
 
 		 221 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 224 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>