47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2715 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  48.26 
 
 		 242 aa  215  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  43.91 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  43.24 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  40.93 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  42.44 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  40.62 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  34.33 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  35.29 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  31.05 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  31.51 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  31.05 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  28.04 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  29.09 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  32.09 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  30.6 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  30.6 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  28.36 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  29.82 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  34.33 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  29.85 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  29.85 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  29.85 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  29.1 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  29.1 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  29.85 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  29.1 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  29.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  24.24 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  27.96 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  30.08 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  30.91 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  27.64 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  34.03 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  27.51 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1813  hypothetical protein  41.27 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000218616  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  26.85 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  30.97 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>