129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1762 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 332 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  48.1 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  44.51 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  39.81 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  47.67 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  42.12 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  36.54 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  34.84 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  38.71 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  41.43 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  40.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  38.51 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  38.36 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  37.07 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  43.12 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  41.9 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  39.17 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  39.32 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  37.42 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  40.32 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  36.48 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  40.14 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  41.43 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  32.48 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  39.37 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  35.78 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  35.78 
 
 		 247 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  37.82 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  38.92 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  27.3 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28.17 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  26.6 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.6 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  26.6 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  26.6 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  26.6 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.46 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  26.6 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.21 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  33.71 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  38.92 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  39.1 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  37.25 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  35.11 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  26.07 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  31.27 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  29.49 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  27.22 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  26.07 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  23.51 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  24.08 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.5 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  28.66 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  32.41 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  27.59 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  28.37 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.89 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  23.77 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  25.85 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  28.37 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  28.45 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  28.7 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  23.78 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  23.51 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  27.27 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  28.22 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  25.21 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  27.12 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  23.16 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  27.91 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  24.75 
 
 		 355 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  23.23 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  23.23 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  25.83 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  27.96 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.8 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  27.95 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  25.32 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  24.45 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  26.85 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  26.43 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4522  arsenical-resistance protein  30.59 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4609  arsenical-resistance protein  30.59 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4905  arsenical-resistance protein  30.59 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  28.85 
 
 		 360 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  25.49 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.3 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>