200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1950 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  100 
 
 		 357 aa  719    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  64.63 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  62.06 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0960  basic membrane lipoprotein  36.59 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  36.22 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  34.86 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  37.18 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  37.09 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  37.54 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  35.61 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  35.01 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0961  basic membrane lipoprotein  34.64 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  35.55 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  35.47 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  35.55 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  35.55 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  35.55 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  35.55 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  35.55 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  35.42 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.99 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2259  basic membrane lipoprotein  38.78 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000485708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  34.07 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.84 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  36.56 
 
 		 355 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 713 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  36.07 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  33.42 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  32.13 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  35.93 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  30.85 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  36.81 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  32.53 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  35.29 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  32.95 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  33.78 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.69 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  31.28 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  31.44 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  31.44 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.29 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  31.93 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  31.61 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  31.76 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  32.21 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2034  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  30.46 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  32.2 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.66 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  32.68 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  31.33 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  30.31 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  30.68 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  31.22 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  31.44 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  30.9 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  30.46 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  32.55 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  30.66 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.95 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  30.72 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  32.32 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  32.08 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  30.36 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  32.06 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  28.15 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.85 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  29.03 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  28.79 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.71 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  31.77 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  28.08 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  29.94 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  30.89 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>