55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1126 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1126  TPR domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  487  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
301 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 
639 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 
1056 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
818 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.52 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3710  predicted protein  37.29 
 
 
421 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000932584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
404 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
3560 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  28.28 
 
 
205 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
784 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
286 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.58 
 
 
1979 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.12 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
1127 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.97 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
547 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
878 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 
810 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.81 
 
 
462 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.17 
 
 
706 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
1014 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
1276 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
707 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
371 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
465 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
576 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
1737 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
1421 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
392 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
649 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  34.38 
 
 
706 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3172 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
968 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
523 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 
871 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 
750 aa  42  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>