More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0773 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0773  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  57.62 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  54.79 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0495  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 293 aa  236  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  51.95 
 
 		 275 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  52.19 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  51.25 
 
 		 341 aa  231  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 219 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 217 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  53.49 
 
 		 219 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  51.35 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 223 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  53.05 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  51.91 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  54.79 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  52.68 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  52.68 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  49.38 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  49.38 
 
 		 275 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 302 aa  225  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  50 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 220 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 254 aa  224  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  45.9 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  53.62 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  53.62 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  51.36 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  51.36 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  52.66 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  50.93 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>