More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0778 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 419 aa  843    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  62.62 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  63.22 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  62.62 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 484 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  61.37 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  61.84 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  62.35 
 
 		 437 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 421 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 421 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  63.13 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 421 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  61.78 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  63.7 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  60.63 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  63.81 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  63.81 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  62.8 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  63.08 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  60.73 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  61.43 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 421 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  61.67 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  60.73 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 418 aa  524  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  61.76 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  61.9 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  60.34 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.62 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  61.65 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  62.69 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  61.67 
 
 		 421 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  61.65 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  61.3 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  59.42 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0309  transcription termination factor Rho  63.94 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47410  transcription termination factor Rho  63.94 
 
 		 419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2293  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  59.42 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  60.58 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  61.78 
 
 		 418 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  63.05 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  60.58 
 
 		 506 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 419 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  60.44 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>