More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2628 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  53.78 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  51.41 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.81 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.88 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  51 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.59 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.8 
 
 		 268 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.76 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  50.41 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  50.41 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  50.41 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  47.06 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  41.83 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  43.83 
 
 		 267 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.02 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.85 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.3 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  46.05 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  45.24 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  46.49 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  43.27 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  45.61 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  45.61 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  43.67 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  44.4 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  41.8 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.29 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  44.31 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.22 
 
 		 304 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.7 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  45.31 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  41.99 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  42.98 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.02 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.65 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  44.4 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  46.26 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  44.8 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  44.4 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.51 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  42.62 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  43.21 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  39.92 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.36 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  45.9 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.09 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  39.52 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.64 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.62 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.32 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  40 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  43.5 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  43.5 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.7 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  42.15 
 
 		 436 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  44.49 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.72 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  38.67 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  40.55 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  44.53 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.3 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  41.56 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  38.81 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.91 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.27 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.91 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.97 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.3 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.91 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.83 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.31 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.06 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  42.92 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.92 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  44 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.8 
 
 		 436 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>