More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1589 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1589  putative modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 429 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.880571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.25 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.36 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.12 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  52.8 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.84 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.41 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  31.75 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.08 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  22.6 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.35 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23.7 
 
 		 449 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.15 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  26.24 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.48 
 
 		 462 aa  103  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.12 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.8 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.93 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.35 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 435 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.65 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.58 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.76 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.72 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.45 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.89 
 
 		 467 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  22.82 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  32.73 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.59 
 
 		 476 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 		 497 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.95 
 
 		 462 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.28 
 
 		 453 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  32.17 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  26.24 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  32.16 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  24.34 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.86 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  31.48 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  26.24 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.92 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.3 
 
 		 493 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 479 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  32.14 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.31 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  32.6 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  32.6 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  32.61 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  29.36 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.6 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.12 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  23.92 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  30.52 
 
 		 481 aa  87  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 		 470 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.78 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.81 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  26.27 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.17 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  25.28 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.28 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  22.92 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  32.88 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  32.16 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.51 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  29.46 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.17 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  33.19 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  33.19 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  30.09 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  30.84 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.04 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.14 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.2 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  30.33 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  30.33 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  30.33 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.41 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.92 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.51 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>