More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0596 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  75.9 
 
 		 330 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  72.79 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  70.39 
 
 		 328 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  59.45 
 
 		 310 aa  363  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  59.52 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  59.39 
 
 		 304 aa  362  4e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  55.79 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  51.8 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  51.48 
 
 		 310 aa  334  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  53.98 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  52.63 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  52.94 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  52.25 
 
 		 311 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  45.03 
 
 		 392 aa  250  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  44.08 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  44.15 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  39.08 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 284 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  35.49 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.25 
 
 		 280 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.82 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 382 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.34 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  36.65 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 279 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  35.85 
 
 		 377 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.52 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  29.17 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  33.17 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.02 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  34.29 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  33.33 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  30.12 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  30.86 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  33.33 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.07 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.57 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  40.57 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  43.52 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  32.96 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  29.33 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  33.64 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.48 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  40 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.82 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.7 
 
 		 207 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  40.78 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  36.45 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.27 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>