More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1278 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  58.3 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.09 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.48 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.33 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  37.33 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  39.47 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  40.18 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  34.05 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  38.26 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.2 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  36.16 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.77 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  32.9 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.93 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.75 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  35.05 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  35.05 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.04 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  34.02 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.36 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.66 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.34 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  37.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  37.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  34.88 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.21 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  36.25 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  33.72 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.35 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  29.06 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.84 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.29 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  28.21 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  37.93 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.27 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.3 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  34.83 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.9 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  38.89 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  36.36 
 
 		 344 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.19 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 348 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  34.86 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  34.83 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.77 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.79 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  43.18 
 
 		 400 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.55 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.17 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  43.18 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  34.44 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  36.78 
 
 		 400 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  28.21 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  40.54 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  38.46 
 
 		 399 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.54 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  32.94 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.16 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  35 
 
 		 305 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  36.14 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.44 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.28 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 356 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.83 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 422 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  37.36 
 
 		 395 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  39.77 
 
 		 399 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  32.6 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.84 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.84 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>