86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1006 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1006  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188387  normal  0.916441 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  32.89 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  32.89 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  33.16 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  35.52 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  32.63 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  36.19 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  30.29 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  31.66 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  29.67 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  28 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  35.43 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  33.56 
 
 
233 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  33.06 
 
 
250 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  29.52 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  30.92 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  30.41 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1589  major intrinsic protein  31.09 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  30.59 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  28.1 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  27.7 
 
 
281 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  43.33 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  33.06 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  30.41 
 
 
279 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  28.48 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  32.73 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  37.04 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  39.22 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  27.45 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  28.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  28.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  28.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  28.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  28.17 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  27.7 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  37.04 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  30.26 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  37.04 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  30.26 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  30.26 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  30.41 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  33.33 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  30.2 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  35.56 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  36.26 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  27.7 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  28.64 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  28.48 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  35.56 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  35.29 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  37.04 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  37.04 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  36.11 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  29.52 
 
 
283 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  31.51 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  34.55 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  29.52 
 
 
318 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  34.48 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  26.06 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  26.59 
 
 
449 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  40 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  26.79 
 
 
269 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  36.11 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  36.11 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  36.11 
 
 
247 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.64 
 
 
453 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>