35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3543 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 313 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  75.65 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  70.86 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  66.45 
 
 		 302 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  64.76 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  64.76 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  63.92 
 
 		 328 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  64.44 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  61.2 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  59.32 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  62.67 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 		 331 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  60.51 
 
 		 331 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  60.13 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 274 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  36.93 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  27.12 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  27.24 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  26.28 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.94 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  26.88 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.28 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.24 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  24.45 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  22.74 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  20.26 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>