More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1708 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  86.49 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  83.78 
 
 		 301 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  86.82 
 
 		 296 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  79.39 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  79.39 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  79.39 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  79.05 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  80.07 
 
 		 301 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  78.72 
 
 		 300 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  78.62 
 
 		 306 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  78.62 
 
 		 306 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  78.95 
 
 		 306 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  78.29 
 
 		 306 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  77.36 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  77.56 
 
 		 305 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  78.22 
 
 		 305 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  77.56 
 
 		 305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  77.23 
 
 		 305 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  77.89 
 
 		 305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  70.71 
 
 		 299 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  70.95 
 
 		 310 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  75.76 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  60.87 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  60.54 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  60.54 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  59.87 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  60.87 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  60.87 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  59.87 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  60.54 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  61.87 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  60.87 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  60.87 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  60.2 
 
 		 301 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  60.2 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  59.53 
 
 		 302 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  59.87 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  61.54 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  61.87 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  60.54 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  57.19 
 
 		 304 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  57.19 
 
 		 304 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  57.19 
 
 		 304 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  56.23 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  60.54 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  55.59 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  60 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  52.54 
 
 		 313 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  55.74 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  53.51 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  53.06 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  54.36 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  52.72 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  50 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  54.73 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  51.53 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  54.73 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  52.19 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  52.53 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  47.8 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  50 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  51.69 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  46.08 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  48.65 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  48.17 
 
 		 312 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  51.34 
 
 		 305 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  51.34 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  48.99 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  50.68 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  51.43 
 
 		 282 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  47.47 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  42.76 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  50.68 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  43.96 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  40.4 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.75 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  41.75 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.75 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.75 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.75 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.75 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  41.22 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  45.79 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.46 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.08 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  45.12 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.74 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.86 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  40.2 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  38.71 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.18 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  36.82 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  37.12 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  38.87 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.41 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.41 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.41 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1335  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.41 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>