51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1748 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  44.94 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.74 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.15 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  43.48 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  39.51 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  40.85 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  39.71 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.18 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.68 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.77 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  38.04 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.71 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.63 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  35.37 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  38.81 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  32.97 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  43.59 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.59 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.14 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  33.82 
 
 		 92 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  35.59 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.03 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  38.57 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.74 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.25 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  33.8 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  34.72 
 
 		 99 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>