228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1106 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  100 
 
 		 227 aa  456  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  41.83 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  40.49 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  38.61 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  35.8 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  36.65 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  35.22 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  33.76 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  32.7 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  36.36 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  36.42 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  33.54 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  30.41 
 
 		 286 aa  101  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  31.21 
 
 		 286 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  31.85 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  34.85 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  33.93 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  29.22 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  29.22 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  30.89 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  34.73 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  29.22 
 
 		 289 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  32.74 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  30.63 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  35.42 
 
 		 172 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  32.91 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  31.52 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  31.58 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  35.82 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  36.5 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  37.9 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  30.52 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  33.09 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  31.65 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  31.72 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  31.08 
 
 		 175 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  30.26 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  32.73 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  28.22 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  29.38 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  31.47 
 
 		 147 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  31.69 
 
 		 173 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  29.81 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  27.88 
 
 		 286 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  41.51 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  28.37 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  29.93 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  32.85 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1786  hypothetical protein  32.5 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  32.85 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  32.85 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28.47 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.59 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  31.97 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  28.17 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  31.54 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  32.28 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1525  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1643  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.34 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1710  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  30.08 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  31.87 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  27.01 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  28.06 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  28.17 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  26.03 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>