More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0885 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 184 aa  247  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  63.04 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  233  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  65.52 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  60 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  61.96 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 187 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  59.89 
 
 		 184 aa  220  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  59.12 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  57.07 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  56.91 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  57.07 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 186 aa  210  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  51.32 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  48.94 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>