201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4951 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  43.24 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 327 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  44.71 
 
 		 343 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  39.76 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  41.88 
 
 		 361 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  40.52 
 
 		 337 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.08 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  24.7 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  24.4 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  32.61 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  24.12 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.21 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.43 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  32.28 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  27.46 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.43 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  30.63 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  27.85 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  28.81 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  29.81 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  28.81 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  35.94 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  35.24 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  34.35 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  33.59 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  26.53 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  27.08 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  33.87 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.43 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  29.84 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  28.65 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  34.38 
 
 		 311 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  33.04 
 
 		 369 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 305 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.71 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.59 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  33.59 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.59 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  31.58 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.06 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  29.55 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  34.43 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  33.6 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  28.98 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  33.86 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.11 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.68 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.47 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.6 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  33.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  28.38 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  30.4 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  28.1 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  33.06 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.06 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  32.8 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  31.5 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.38 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  38.17 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.26 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  32.8 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  33.6 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.26 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.26 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.66 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  28.68 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  29.19 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  32.81 
 
 		 311 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  30.47 
 
 		 313 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.5 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 296 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  25.79 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  27.62 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  29.37 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>