More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3627 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.93 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  55.45 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  51.42 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 		 269 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.28 
 
 		 255 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.66 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.07 
 
 		 263 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.12 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  49.51 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  48.34 
 
 		 251 aa  187  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 252 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 247 aa  178  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  48.53 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 254 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.82 
 
 		 662 aa  104  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.18 
 
 		 662 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.71 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.43 
 
 		 662 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 257 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  37.29 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 259 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  30.24 
 
 		 269 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 		 258 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  35.07 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.26 
 
 		 661 aa  93.2  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 259 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 273 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 258 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 		 259 aa  91.7  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 		 254 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.31 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.31 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  29.33 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  33.52 
 
 		 276 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.66 
 
 		 259 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 257 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 257 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 259 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  30.1 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  29.33 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30.14 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.1 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>