More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2096 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.479548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1418  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.14 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
246 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.29 
 
 
256 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
265 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187404  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0432  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
241 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0311  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0837369  hitchhiker  0.00000385306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0328  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
244 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.01 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4611  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
241 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.62 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3525  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
241 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
243 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.982216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3902  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00423797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609253  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
247 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5109  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.4 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0423  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
242 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.43 
 
 
251 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
255 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  29.67 
 
 
265 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
253 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
247 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
269 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
249 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.29 
 
 
248 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
248 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
261 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
261 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.65 
 
 
261 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.06 
 
 
261 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0336  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
241 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0333  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
241 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.95 
 
 
248 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
257 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
268 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
248 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.455757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
246 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
252 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
248 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0338  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
241 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
288 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0336  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
241 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0107  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.27 
 
 
242 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  32.28 
 
 
248 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
297 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
255 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.78 
 
 
255 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4773  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3696  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
254 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
247 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
269 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  32.16 
 
 
256 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
246 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
250 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
241 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.6 
 
 
263 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.2 
 
 
250 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
288 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
255 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
285 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
255 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
287 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
254 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.397771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
250 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
250 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3052  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
241 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427692  normal  0.158373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
278 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0702  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
241 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
249 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
246 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
249 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
362 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
252 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.86 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  28.74 
 
 
252 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.43 
 
 
248 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
287 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.24 
 
 
247 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
247 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.3 
 
 
248 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
254 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
288 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>