More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1814 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
391 aa  768    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
370 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  32.22 
 
 
371 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  32.13 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
373 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
373 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
366 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
410 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
373 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
372 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3883  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3771  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.607496  normal  0.0472047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
427 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 
378 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
373 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
394 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
395 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
420 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
377 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.82 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  28.74 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
393 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
368 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  29.81 
 
 
367 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
441 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
373 aa  86.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  27.16 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  28.06 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
383 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  24.51 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  24.17 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.17 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  25.56 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.44 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  25.53 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  27.54 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.2 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  25.37 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.3 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  26.53 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  22.78 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
816 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
820 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.76 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  25.53 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.86 
 
 
803 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
655 aa  70.5  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  22.19 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.32 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
871 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.12 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>