More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1526 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
652 aa  1325    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4783  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.88 
 
 
604 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158368  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0801  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.13 
 
 
594 aa  225  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.78 
 
 
568 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.82 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2924  acetolactate synthase catalytic subunit  25.59 
 
 
576 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10808  thiamine pyrophosphate enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13620)  26.73 
 
 
562 aa  137  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  27.73 
 
 
539 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.74 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2939  acetolactate synthase catalytic subunit  29.67 
 
 
570 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.653705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  26.96 
 
 
528 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.46 
 
 
589 aa  127  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  27.05 
 
 
533 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.88 
 
 
658 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26 
 
 
572 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3304  acetolactate synthase catalytic subunit  27.6 
 
 
567 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15200  acetolactate synthase catalytic subunit  29.13 
 
 
586 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.47 
 
 
596 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.51 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.76 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4098  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  42 
 
 
595 aa  121  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4075  acetolactate synthase catalytic subunit  27.32 
 
 
611 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.93 
 
 
562 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  25.98 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.93 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.74 
 
 
568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.75 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.45 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  24.7 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  22.87 
 
 
587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.17 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.93 
 
 
562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.93 
 
 
566 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.01 
 
 
551 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  25.82 
 
 
549 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  26.5 
 
 
591 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  25.82 
 
 
528 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  22.87 
 
 
587 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  22.7 
 
 
587 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.57 
 
 
540 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.69 
 
 
525 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.99 
 
 
540 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  21.76 
 
 
587 aa  107  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.13 
 
 
561 aa  107  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.5 
 
 
562 aa  107  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.49 
 
 
499 aa  107  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  25.39 
 
 
518 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.33 
 
 
529 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.7 
 
 
582 aa  104  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.65 
 
 
557 aa  104  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  31.1 
 
 
539 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  23.21 
 
 
586 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0968  thiamine pyrophosphate protein central region  26.39 
 
 
563 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.04 
 
 
552 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  21.88 
 
 
572 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  26.21 
 
 
528 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.01 
 
 
556 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.4 
 
 
552 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.05 
 
 
552 aa  100  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.72 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  23.17 
 
 
573 aa  99  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  23.47 
 
 
640 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  27.89 
 
 
564 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  22.41 
 
 
566 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.75 
 
 
600 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  24.87 
 
 
591 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.01 
 
 
565 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.05 
 
 
503 aa  97.4  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  26.69 
 
 
567 aa  97.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  23.04 
 
 
576 aa  97.4  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  24.17 
 
 
562 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0947  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  21.46 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  30.86 
 
 
548 aa  97.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  26.37 
 
 
541 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  25.3 
 
 
591 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  23.98 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  23.98 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  23.98 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.61 
 
 
563 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  23.98 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.09 
 
 
554 aa  95.1  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0852  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.7 
 
 
552 aa  95.1  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.53 
 
 
554 aa  94.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  25.13 
 
 
587 aa  94.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  25 
 
 
545 aa  94  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  24.05 
 
 
562 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.93 
 
 
563 aa  93.6  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.92 
 
 
581 aa  93.2  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0432  acetolactate synthase catalytic subunit  22.7 
 
 
538 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  22.18 
 
 
573 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.78 
 
 
536 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  23.64 
 
 
562 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  24.83 
 
 
576 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  21.79 
 
 
555 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>