More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0113 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  50.24 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  46.92 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.76 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  46.45 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  40.85 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  44.39 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  44.34 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.93 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  40.57 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  37.06 
 
 		 186 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.45 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  36.65 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.56 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  38.01 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  36.19 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  39.15 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  36.84 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  39.25 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.21 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  38.57 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.57 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  34.29 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  34.1 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.38 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  40.88 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.92 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.11 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.58 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.59 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.81 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  31.78 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  35.19 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.57 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  32.24 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  28.11 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  28.11 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  34.83 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  28.22 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  48.86 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  32.23 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  30.36 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  29.72 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  30.32 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  29.33 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  24.75 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  41.49 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  30.69 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  29.86 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  42.35 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  31.09 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  35.66 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  31.13 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.58 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  30.19 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  43.18 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  40.43 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  31.28 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  40.43 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  30.68 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  30.95 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  42.35 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  39.33 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  31.28 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.67 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  26.69 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  28.64 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  39.33 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  30.9 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2762  maleylacetoacetate isomerase  42.17 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.36 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  39.36 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  39.33 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  40.4 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.34 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.492964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>