More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  66.5 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  63.11 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  62.14 
 
 		 207 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  62.14 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  62.14 
 
 		 207 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  62.14 
 
 		 207 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  61.11 
 
 		 299 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  60 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  64.62 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  62.5 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  59.22 
 
 		 209 aa  268  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  59.22 
 
 		 209 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  61.17 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  58.54 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  59.41 
 
 		 226 aa  260  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  60.61 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  59.8 
 
 		 200 aa  254  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  59.28 
 
 		 203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  57.49 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  57.28 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  58.74 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  53.73 
 
 		 202 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  55.94 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  55.34 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  55.34 
 
 		 209 aa  237  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  54.37 
 
 		 207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  44.27 
 
 		 269 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  46.43 
 
 		 348 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  44.67 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  45.41 
 
 		 437 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  42.27 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  44.21 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  44.44 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  43.3 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  45.73 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  43.63 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  45.54 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  43.06 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  44.33 
 
 		 227 aa  173  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  42.19 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  44.33 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 304 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 304 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  43.07 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  40.51 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  41.21 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.07 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  39.32 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  44.02 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  43.41 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  43.37 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  42.29 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  42.93 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  42.21 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  43.69 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  45.92 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  42.58 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  39.8 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
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NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  40.7 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  41.87 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
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NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  41.84 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  44.5 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
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NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  43.28 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  42.44 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  41.38 
 
 		 202 aa  161  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  41.31 
 
 		 211 aa  160  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  43.48 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  41.29 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
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NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  41.38 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  38.73 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  44.28 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
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NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  43.81 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
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NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  41.38 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  42.13 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  41.21 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
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NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  41.26 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
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