More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 162 aa  313  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  66 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  65.56 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  54.78 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  51.85 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  50.31 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  56.52 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  54.97 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  54.97 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  54.97 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  54.42 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  53.02 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  49.34 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  53.06 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  52.29 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  51.08 
 
 		 433 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  55.97 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  66.94 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  66.67 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  59.69 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  53.47 
 
 		 438 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  48.77 
 
 		 432 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  48.51 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  44.59 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  43.8 
 
 		 416 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  45.7 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  48.89 
 
 		 427 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  39.24 
 
 		 423 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 414 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.17 
 
 		 424 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  44.62 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  42.36 
 
 		 412 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  104  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  42.36 
 
 		 413 aa  104  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.65 
 
 		 415 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  48.55 
 
 		 410 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  48.59 
 
 		 434 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  42.41 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  38.12 
 
 		 412 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  50.97 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  42.11 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  41.83 
 
 		 432 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.21 
 
 		 436 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  44.05 
 
 		 408 aa  101  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  40.97 
 
 		 412 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.01 
 
 		 411 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  40.28 
 
 		 412 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  49.62 
 
 		 408 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  40.97 
 
 		 412 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.41 
 
 		 413 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  49.62 
 
 		 408 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  49.62 
 
 		 408 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.17 
 
 		 433 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.97 
 
 		 415 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.58 
 
 		 371 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  55.3 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  41.82 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  40.94 
 
 		 420 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  45.58 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  30.46 
 
 		 362 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 		 420 aa  96.3  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  37.93 
 
 		 364 aa  95.9  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  34.67 
 
 		 363 aa  96.3  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  42.04 
 
 		 413 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  37.84 
 
 		 365 aa  95.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  46.2 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.81 
 
 		 415 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 411 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.61 
 
 		 420 aa  94  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.18 
 
 		 431 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  35 
 
 		 415 aa  93.6  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  46.72 
 
 		 422 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  37.25 
 
 		 165 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.17 
 
 		 408 aa  90.9  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.42 
 
 		 419 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  43.12 
 
 		 447 aa  90.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  36.71 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  37.42 
 
 		 437 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 416 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  43.33 
 
 		 421 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  36.77 
 
 		 413 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 		 414 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 416 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.27 
 
 		 414 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  47.73 
 
 		 426 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  34.53 
 
 		 411 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  40.54 
 
 		 413 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  40.46 
 
 		 415 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  41.1 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  29.68 
 
 		 408 aa  88.6  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.54 
 
 		 408 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.71 
 
 		 419 aa  88.6  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  46.22 
 
 		 419 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  38.69 
 
 		 420 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  42.38 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>