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for query gene Svir_05590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 502 aa  971    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  57.95 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  57.95 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  57.95 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11439  aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein  56.77 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.252345  normal  0.125913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2691  major facilitator superfamily transporter  60.12 
 
 		 528 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  60.34 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2329  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827746  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3725  major facilitator transporter  58.47 
 
 		 521 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112434  normal  0.052202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  54.28 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  53.6 
 
 		 529 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  55.05 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 525 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.54 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  28.78 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.14 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.14 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.14 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.94 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.73 
 
 		 513 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.73 
 
 		 513 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.72 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.27 
 
 		 511 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.78 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.27 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 		 515 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.94 
 
 		 507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  24.94 
 
 		 507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_008699  Noca_2951  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380575  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 539 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 508 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 565 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 592 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 504 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 512 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 641 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 		 676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.53 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.69 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.11 
 
 		 466 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 672 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.56 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  27.05 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  27.05 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  26.79 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 678 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.46 
 
 		 680 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 569 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 		 509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.17 
 
 		 535 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.96 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
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NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.57 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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