More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2193  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.91 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.91 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.91 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  37.38 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  45.07 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  31.08 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  46.97 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  45.07 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  43.66 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  45.07 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  45.45 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.68 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  47.69 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  43.66 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  46.58 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  50 
 
 		 329 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  43.66 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  43.66 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  43.66 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  43.66 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  43.66 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  43.66 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  43.66 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  36.9 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.96 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.43 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  50.88 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40.85 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.65 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.09 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  40.58 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  50.98 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  45.71 
 
 		 314 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  41.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  45.71 
 
 		 314 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.71 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  49.12 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.61 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  33.94 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  35.8 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  49.02 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  49.02 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.29 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  47.06 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  42.42 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  45.71 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  31.53 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  46.43 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  37.5 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  31.48 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.37 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  30.48 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.37 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>