More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1864 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  100 
 
 		 430 aa  895    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  63.16 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  59.95 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  57.31 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  54.96 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  57.38 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  55.45 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  54.96 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  54.72 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  45.08 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  42.54 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  40.46 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  43.71 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  40.84 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  47.14 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  46.8 
 
 		 409 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  41.81 
 
 		 438 aa  265  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  39.69 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  41.35 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  37.47 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  42.64 
 
 		 434 aa  263  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  37.5 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  40.95 
 
 		 476 aa  259  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  39.38 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  38.27 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  39.2 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  38.27 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.94 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  38.27 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  40.56 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  40.56 
 
 		 458 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  37.32 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  37.32 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  37.32 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  40.39 
 
 		 462 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  42.77 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  37.32 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  36.43 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  36.67 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.34 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  36.76 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  36.98 
 
 		 455 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  38.63 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  42.51 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  36.74 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  38.01 
 
 		 478 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  39.89 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  41 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  36.74 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  36.5 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  36.5 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.18 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  37.05 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  38.92 
 
 		 469 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  36.21 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  36.25 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  40.56 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  38.74 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  36.93 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  38.46 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.83 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  40.78 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  43.04 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  39.84 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  36.88 
 
 		 461 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  41.48 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  39.82 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  41.34 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  37.2 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  37.87 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  37.38 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  37.62 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  43.07 
 
 		 548 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  40 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  41.95 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  39.56 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  39.37 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  38.22 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  39.76 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  39.51 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  39.3 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  39.12 
 
 		 410 aa  240  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  37.22 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  39.34 
 
 		 404 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  41.56 
 
 		 407 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  39.3 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0251  putative protease  38.21 
 
 		 466 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  34.86 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>