287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1736 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1736  HI0933-like protein  100 
 
 		 384 aa  784    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1509  HI0933 family protein  46.34 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000081979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0409  oxidoreductase with FAD/NAD  41.93 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0743  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.15 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.276472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  36.22 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  37.89 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  37.66 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  35.46 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  35.2 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  36.07 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  37.47 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  34.67 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  38.32 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  34.29 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  38.32 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  38.07 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  38.07 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  34.96 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  36.32 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  34.26 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  36.99 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  36.46 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  37.82 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  37.56 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  36.48 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  37.56 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  37.4 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  37.31 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  37.06 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  35.81 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  37.06 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  35.28 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  35.28 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  37.24 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  35.28 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  35.53 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  34.27 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  35.28 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  36.43 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  36.62 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  37.72 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  35.1 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  35.03 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  35.04 
 
 		 460 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  33.59 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  34.95 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  33.84 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  37.31 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  34.82 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  35.04 
 
 		 460 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  36.13 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  36.8 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  33.84 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  34.69 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  34.81 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  33.93 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  36.55 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  35.13 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  36.15 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  35.2 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  34.73 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  34.92 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  35.5 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  31.8 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  34.73 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  36.05 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  37.44 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  36.43 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  35.09 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  35.06 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  32.84 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  34.9 
 
 		 406 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  35.66 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  35.6 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  35.14 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  32.93 
 
 		 419 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  36.52 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  36.52 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  36.52 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  34.64 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  36.62 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.36 
 
 		 397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  34.28 
 
 		 411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1357  hypothetical protein  34.31 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  34.53 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  36.62 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  35.77 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  33.5 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  35.16 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  36.11 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  32.52 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  35.9 
 
 		 407 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  35.5 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  35.28 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  35.28 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  35.28 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  35.28 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>