More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1244 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  55.6 
 
 		 885 aa  998    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  49.44 
 
 		 879 aa  863    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  49.22 
 
 		 879 aa  857    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  100 
 
 		 902 aa  1840    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  49.78 
 
 		 879 aa  877    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  48.5 
 
 		 875 aa  849    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  49 
 
 		 879 aa  858    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  49.11 
 
 		 879 aa  850    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  48.44 
 
 		 875 aa  846    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 891 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 936 aa  582  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 892 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 892 aa  562  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 934 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 888 aa  562  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 892 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 892 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 898 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 916 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 935 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 892 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 915 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 908 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 926 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 956 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.58 
 
 		 934 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 928 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 930 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 905 aa  537  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  36.06 
 
 		 908 aa  536  1e-151  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  34.79 
 
 		 907 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 988 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 931 aa  535  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 930 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 915 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 924 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 910 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 928 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 928 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 922 aa  529  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 915 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 929 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 896 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 928 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  35.13 
 
 		 915 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 903 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 915 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 951 aa  528  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 913 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 929 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 902 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 979 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 908 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 978 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 930 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 932 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  35.13 
 
 		 943 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 932 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 893 aa  522  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  34.41 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 939 aa  522  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 953 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 931 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 917 aa  522  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  35.16 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 939 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  35.58 
 
 		 918 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  33.47 
 
 		 1022 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.25 
 
 		 934 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  35.44 
 
 		 902 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 896 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  35.53 
 
 		 903 aa  519  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 945 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 926 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 932 aa  519  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 902 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 922 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 922 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 949 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>